湄洲之西，有一個地方叫文夾（今名文甲），為湄洲灣出入的要沖。礁石夾雜，分布其地。有一次有艘商船經過這里遭到巨風襲擊，船角觸礁，海水涌進船艙，情況十分危急，船中人哀號求救，媽祖知道后，非常焦急，忙對村民說：哆頭商船即將沉沒，應趕快前去援救。可是大家看著狂風巨浪，不敢向前。在這緊急關頭，媽祖信手將腳邊小草，找了幾根，拋向大海。剎時間，幾根小草變成大杉，排駕流向船旁，商舟有大杉相附，于是不致沉沒。不一會，風平浪息，船上的人相慶大難不死，都以蒼天相助，互相慶賀。待到將船靠岸，忽發現大木不知去向，經詢問鄉人，才知化草成杉附舟，乃是媽祖的神奇功力。這就是傳說中的《化草救商》。

話說當時湄洲嶼西北方有二神：一聰而善聽，號順風耳。一明而善觀，號千里眼。二神經常出沒作崇，村民甚受其苦，祈求媽祖懲治。神姑于是混雜在婦女當中上山采摘，經十余日，方與之相遇。二神誤以為媽祖是民間女子，將近前，經媽祖將手中絲帕一拂，遂霾瘴蔽空，狂風卷地，兩怪仍持斧疾視。媽祖說：敢擲下你們手中的斧么？他們竟然丟下，但再也收不起來，因而咋舌伏法。兩年后，二神又出來作崇。這次是在水上出現，乘濤騎沫，沉浮滾蕩。當時巫覡都治不了它們。媽祖說：“江河湖海，水德攸鐘，彼乘旺相之鄉，須以土木方可克之。”于是演起神咒，林木震蕩，呼呼作響，沙石飛揚，二神無處躲閃，于是拜伏在地，愿歸依媽祖。神姑乃將他們收之為徒，作為耳目，為拯救海難，驅惡揚善效力。

宋太宗雍熙四年（987年），媽祖時年二十八歲。在重陽節的前一天，媽祖對家中人說：“我心好清凈，不愿居于凡塵世界。明天是重陽節，想去爬山登高。預先和你們告別。”大家都以為她要登高遠眺，不知將成仙。第二天早上，媽祖焚了香，念了經，與諸姐說：“今天要登山遠游，實現自己的心愿，但道路難走而且遙遠，大家不得與我同行，”諸姐笑著安慰她說：“要游去游就是了，何須多慮呢！”媽祖于是告別諸姐，直上湄峰最高處，這時，只見湄峰頂上濃云四合，一道白氣沖上天空，仿佛聽見天空有絲竹管弦奏起的仙樂聲，直徹云天，彩虹輝映，媽祖乘長風駕祥云，翱翔于蒼天皎日間。俯視人世，若隱若現。忽然彩云布合，不可復見。湄洲人仰頭望去，無不欷噓驚嘆。此后媽祖經常顯靈，鄉親們時常能看到她在山巖水洞之旁，或盤坐于彩云霧靄之間，或朱衣飛翔海上。常示夢顯圣，救人急難，護國佑民。于是鄉里之人就在湄峰建起祠廟，虔誠敬奉，后人前來朝拜者，絡繹不絕。

媽祖一生在大海中奔馳，救急扶危，在驚濤駭浪中拯救過許多漁舟商船；她立志不嫁慈悲為懷，專以行善濟世為已任。